Attualmente il Museo è allestito nei locali al piano terra della Biblioteca Civica ed espone gli oggetti rinvenuti durante gli scavi del complesso paleocristiano concordiese e quelli che vengono tuttora alla luce nell'area urbana o nel territorio a seguito di lavori agricoli o edilizi.

La prima sala raccoglie i materiali delle necropoli concordiesi, la seconda è stata dedicata ai reperti dell'abitato essenziali per la ricostruzione della vita nell'antica città (anfore, tubature, etc.), la terza sala riunisce materiali rinvenuti nel corso degli scavi del complesso paleocristiano della piazza della Cattedrale.