Il museo è organizzato su due sezioni: una archeologica ed una etnografica ed è affiancato dalle due sezioni distaccate.
La sezione archeologica raccoglie materiale di origine locale ma anche nazionale ed internazionale, tra cui reperti di età romana provenienti da Biassono, Briosco, Verano ed altri di epoca preistorica da Mariano Comense e Carate Brianza.
Nella sezione etnografica sono contenuti oggetti legati alla cultura popolare. Da materiale di uso quotidiano, come arnesi da lavoro ed oggetti di uso domestico, a costumi tradizionali.
Sezione segno scrittura e stampa. Questa sezione presenta l'evoluzione dei metodi comunicativi, dalla nascita della scrittura fino ai giorni nostri.