Il Museo Archeologico, con sede nel seminterrato del seicentesco Palazzo Belgiojoso, documenta gli insediamenti umani dal Paleolitico (Uomo di Neanderthal) all'alto medioevo, presentando tutte le culture (cultura di Polada, cultura di Golasecca, cultura di La Tène, cultura dei vasi a bocca quadrata, Roma antica) che si sono susseguite nel Lecchese.

L'allestimento utilizza un ricco corredo didascalico, che illustra le modalità di rinvenimento dei reperti esposti e le loro funzioni d'uso, ricostruendo l'ambiente, l'abbigliamento e l'armamento dei diversi periodi. A fini divulgativi sono stati realizzati anche plastici, ricostruzioni e copie fedeli di oggetti secondo le tecniche dell'archeologia sperimentale.

Il menhir di Ello (calcolitico), il monetiere, collezioni greche e italiote, e la sala dedicata alla metallurgia completano il percorso.