Il Museo Archeologico Nazionale di Este conserva numerose attestazioni di vetri antichi databili dall'inizio del I ad almeno il IV sec. d.C.; si tratta per lo più di oggetti d'uso comune, realizzati sovente su scala industriale e che dispongono di numerosi confronti su tutto il territorio veneto.

Il museo conserva oltre 65.000 oggetti ed è suddiviso in undici sale con varie sezioni tematiche: al pianterreno sono esposti i reperti archeologici dell'età romana dell'antica città di Ateste, oltre ad una sala dedicata all'epoca medievale e moderna, in cui si può ammirare una pregevole Madonna col Bambino dipinta su tavola da Cima da Conegliano nel 1504 e proveniente dalla chiesa degli "Zoccoli". Al primo piano si trova la sezione protostorica, che conserva le testimonianze dell'epoca paleoveneta.

Inoltre il museo dispone di una biblioteca specialistica, un laboratorio di restauro, una sala conferenze ed ospita regolarmente diverse esposizioni temporanee.