Al suo interno sono raccolte le testimonianze delle popolazioni che risedevano nel territorio attorno al XV sec. Si possono ammirare reperti databili tra il XV ed il XVII secolo, rinvenuti in località Pianzio a Galzignano, all’interno di Villa Benacchio. Una collezione di oltre 150 esemplari della fauna tipica del luogo. La visita la Museo comincia con la sala dedicata alla Storia ed ai Monumenti di Galzignano Terme, per poi procedere al piano superiore in cui un grande pannello realizzato con avanzate tecniche grafiche spiega in maniera semplice il fenomeno Termale euganeo.

Accompagnano i visitatori, attraverso le due grandi sale dedicate all’archeologia e all’ornitologia, una serie di pannelli esplicativi e didattici ed un grande plastico che riproduce gli ambienti ecologicamente più rilevanti dei Colli Euganei.