Il Museo di Anatomia Patologica "Andrea Vesalio" è una preziosa testimonianza della storia dell'Anatomia Patologica veneziana: i reperti custoditi sono rappresentativi degli ultimi due secoli di attività dell'istituzione ospedaliera cittadina. Le origini del Museo si possono far risalire al 1874: è a partire da questa data che nel Regolamento Organico dell'Ospedale viene raccomandato al dissettore anatomico di custodire i reperti ritenuti più interessanti sotto il profilo anatomopatologico.
Nel corso degli anni, le raccolte sono state implementate, grazie al contributo di valenti anatomopatologi: su tutti, spicca la figura di Giuseppe Jona (1866-1943), uomo di straordinaria levatura scientifica e morale, cui il Museo ha dedicato un importante spazio nel percorso espositivo.