Il Museo si articola su quattro piani. Tre sono dedicati ad aspetti che da secoli caratterizzano profondamente il territorio del Centro Cadore: Scienze della vita e della terra (primo piano), Archeologia (secondo piano), Minerali e miniere (quarto piano), mentre uno (il terzo) ospita la sede dell’Associazione Nazionale Alpini, all’interno della quale è esposta una ricca collezione di fotografie e cimeli della Prima Guerra Mondiale.
La sezione archeologica raccoglie e illustra in chiave moderna e puntuale i reperti più significativi rinvenuti nel recente scavo del santuario di Monte Calvario ad Auronzo, nonché alcuni materiali relativi all’abitato auronzano di età romana.