Il percorso museale, completamente sotterraneo, fa rivivere 1.500 anni di storia della popolazione del territorio di Naturno e dintorni. Quattro installazioni multimediali presentano opere del periodo tardo antico, del primo e tardo medioevo e della prima età moderna. Le proiezioni video descrivono, in modo suggestivo e ben comprensibile, le quattro epoche; sono state realizzate con attori non protagonisti scelti tra la popolazione di Naturno e dintorni. Le tombe, rinvenute nel cimitero della peste, testimoniano gli effetti di questa terribile epidemia. Inoltre, nel museo possono essere ammirati gli affreschi gotici della chiesa.