Il museo è situato nell'area degli scavi in cui è possibile visitare i reperti portati alla luce, tra cui l'imponente anfiteatro, in buone condizioni di conservazione e costruito nel II secolo.

La parte museale custodisce i numerosissimi reperti rinvenuti (statuaria, ritrattistica, vasellame domestico, contenitori da trasporto, vetri, lucerne, monete, oggettistica da toilette e d'uso comune), oltre alle sezioni di architettura sacra dedicata al Capitolium, al santuario della dea Luna, al Grande Tempio (con un meraviglioso frammento di pavimentazione repubblicana in "opus signinum", con iscrizione dei duumviri) e al tempio di Diana (antefisse raffiguranti Artemide Persica).

Notevole la sezione epigrafica posta al primo piano e la ricostruzione (con materiale originale) delle domus lunensi, di grande suggestione illustrativa, principalmente approntata, a scopo didattico, per le scolaresche.