Il Museo conserva reperti provenienti dalle aree archeologiche, prima tra tutte la necropoli etrusca, scoperte nei dintorni della città. In due sale sono stati ricomposti affreschi provenienti da due tombe etrusche (probabilmente dalla necropoli dei Settecamini) (nelle cosiddette copie delle Tombe Golini).

Alcuni materiali (ceramiche, bronzi, monili, ecc.) provengono dalle Necropoli del Crocifisso del Tufo e di Cannicella, necropoli site nei dintorni di Orvieto.

Di recente sistemazione è l’allestimento di una sala con i reperti rinvenuti durante le fasi di scavo a Campo della Fiera, probabile sito del Fanum Voltumnae, grande santuario confederale del popolo etrusco.