Il Museo Civico Archeologico è allestito presso il Convento di San Francesco. Al suo interno sono conservati numerosi frammenti scultorei, elementi architettonici ed iscrizioni che testimoniano le diverse fasi evolutive della Trea romana e lo stretto legame con l'Oriente, in particolare con l'Egitto.

Tra i materiali di maggior pregio si ricordano due teste-ritratto, una statua togata acefala e una testina di Mercurio. Di assoluto rilievo la testa del Dio Serapide, appartenente certamente al grande simulacro di culto del Serapaeum treiense. Il Museo si articola in tre stanze: la prima è corredata da una planimetria dell'insediamento romano, da una riproduzione di una pianta topografica degli inizi dell'800 e da pannelli fotografici con informazioni sulla storia e la tipografia di Treia; la seconda è corredata da una mappa del comune di Treia, in epoca romana, con le aree di occupazione e la viabilità; nella terza è conservato il materiale epigrafico e scultoreo con tabelle esplicative. Al Museo archeologico sarà affiancata una sezione con reperti e documenti del "gioco del bracciale".