Il Museo custodisce prevalentemente oggetti di carattere religioso, appartenenti, nella maggior parte, alle chiese del territorio bagnarese. Di particolare rilievo sono gli apparati liturgici in broccato e damasco, le trine e i tessuti ricamati (secc. XVI-XIX); un rarissimo Antifonario e un Graduale, entrambi con xilografie, datati rispettivamente 1520 e 1524 e firmati da Pier Paolo Porro; una Bibbia e una Concordantiae Bibliorum del Cinquecento; altri libri corali, manoscritti e stampe dei secoli XVII e XVIII; vari oggetti di oreficeria, argenteria, coralli, granati, pietre preziose, brillanti; un ostensorio-reliquiario del Seicento in rame dorato e un prezioso calice del Settecento in argento dorato, un atlante completo in 7 quadri, del 1650; maioliche faentine ed imolesi dei secc. XVII e XVIII; un Crocifisso in legno, scuola del Donatello, del sec. XV; mobili; una raccolta di oltre mille monete e medaglie (secc. XVII.XIX).

Sono inoltre conservati dipinti dei secoli XVI -XVIII, compresa una pala d'altare di Innocenzo da Imola, firmata e datata 1515, e una tela di Pietro Bacchi da Bagnara (pittore minore del Cinquecento).