All'interno del Museo sono custoditi ben 352 specie delle quali 215 di Chiavon, 69 di Salcedo e 68 comuni alle due località. La flora suddetta offre analogie con tipi attuali del continente americano, parte con quelli dell'Asia e dell'Africa nonché del continente australiano e del bacino del mediterraneo, mentre quella di Bolca presenta maggiori affinità con le flore attuali delle Indie orientali e dell'Australia. Famosissime le palme, di cui una alta 9 metri, scoperta nel 1863, completa di radici, la cui estrazione richiese 4 anni di lavoro.