Il museo, presso Villa Pace, importante complesso architettonico d'epoca, é stato realizzato grazie alla lungimiranza e all'impegno del Professore Antonio Imbesi, docente emerito di Farmacologia, Preside della Facoltà di Farmacia dell'Università di Messina dal 1968 al 1987. Infatti Antonio Imbesi aveva espresso già da tempo la volontà che gli arredi e le attrezzature della Farmacia materna di Scilla, risalenti alla seconda metà dell'800, servissero come nucleo per la creazione di un "Museo di storia della Farmacia", destinando allo stesso anche libri antichi, stampe e vasi di farmacia di sua proprietà.