Nel 1468 ai carmelitani fu concessa l’officiatura di una piccola chiesa fuori Porta San Giuseppe, a Soncino. A febbraio del 1501 il cardinal Raimondo Perauti, vescovo di Gurk in Carinzia, posò la prima pietra della nuova chiesa, fortemente voluta dal padre Pietro da Mortara. Padre Antonio Maestri, già proveniente dal convento carmelitano di Mantova, era il sovrintende dei lavori. Tra 1515 e il 1526 è stato eretto il campanile, su disegno di maestro Gerardo da Piacenza.

L’edificio sorge su un tratto ormai dimenticato dell’antica strada commerciale di origine romana, l'antica strada Calciana che collegava Bergamo a Cremona. Vi si accede attraverso una scalinata composta da due rampe e ci si trova davanti alla facciata in cotto, da cui emergono lacerti di affreschi, un tempo vi erano dipinte le figure, ora scomparse, di San Rocco e San Cristoforo. Sulla facciata, tripartita da due lesene, si apre un portale di tipo bramantesco, costruito in marmo bianco di Rezzato (marmo Botticino) sopra il quale è visibile, oltre al rosone, anche una statua a tutto tondo della Vergine con il Bambino.

Il vasto ciclo di affreschi che ricopre l'interno è opera di Francesco Scanzi, Giulio Campi, Francesco e Bernardino Carminati. Da ammirare anche una preziosa decorazione in terracotta nello stile dello scultore Giovanni Antonio Amadeo in collaborazione con Agostino De Fondulis.