Il museo di Scienze della Terra conserva collezioni cartografiche, geologiche, mineralogiche, petrografiche, paleontologiche e antropologiche, comprendenti alcune centinaia di campioni, organizzate mediante un sistema ostensivo, costituito da 20 vetrine tematiche; una significativa collezione di rocce ornamentali costituita da espositori a parete con lastre di rocce anche di grandi dimensione, numerosi sussidi didattici di cui alcuni interattivi.
Le collezioni sono esposte nei tre edifici sedi del DSFTA che ospita il Museo.
Tra le peculiarità del Museo, nella sezione mineralogica, vanno evidenziati alcuni grandi campioni : un cristallo di barite di oltre 50 cm di lunghezza che rappresenta un primato mondiale per il Museo trattandosi del più grande di questa specie fino ad oggi ritrovato. Due grandi campioni zolfo provenienti dalle miniere siciliane, un campione di malachite botroidale dell’ex Congo e un cristallo di quarzo, con inclusi cristalli di shorlite, proveniente dal Brasile.