Il Museo Diocesano di Arte Sacra si trova nei sotterranei della Cattedrale, nelle cripte dell’antica chiesa romanica su cui è stata in seguito edificata la chiesa di Sant’Antonio Abate. Questi ambienti sono sono stati restaurati ed ospitano le sale del museo, dove sono conservati alcuni degli arredi e delle suppellettili liturgiche della Cattedrale.

Si tratta del “Tesoro della Cattedrale”, parte integrante della storia della Diocesi di Ampurias: oggetti liturgici d’argento, croci d’altare barocche, portaincenso, reliquiari e paramenti da cerimonia, mitre e candelabri. Altri pezzi di pregio sono le statue lignee di scuola lombardo-emiliana, come la Madonna di Salasgiu e la statua del patrono.

Sono qui esposte le altre opere del Maestro di Castelsardo, facenti parte del retablo che comprendeva l’attuale pala d’altare della Cattedrale. Si tratta del San Michele, dei Quattro Apostoli e della Trinità, tavole dipinte su fondo oro dove lo stile inconfondibile del Maestro si rivela dai dettagli, come il contrasto tra la ricerca della volumetria nei volti dei personaggi e la parti decorative in rilievo.