Il museo è allestito nel salone della Curia Diocesana in Arco Duomo ad Altamura, include nel percorso di visita gli straordinari matronei della duecentesca cattedrale.

L’allestimento delle sale espositive, pensato per una fruizione quanto più possibile semplice per il visitatore, comprende due livelli, tra i quali spiccano i matronei della Cattedrale altamurana, gallerie che corrono lungo la parte superiore delle navate laterali della chiesa dell’Assunta, che ospitano manufatti che vanno dal XV al XIX secolo, divise in cinque grandi sezioni: Argenti, Paramenti, Scultura lapidea, Scultura lignea e Archivio.