La Collezione degli strumenti d'epoca di Fisica si è formata nel tempo dalla fusione di tre collezioni principali: la Collezione dell'Istituto di Fisica Sperimentale, quella dell'Istituto di Meccanica Razionale e quella dell'Istituto di Fisica. A ciò si deve aggiungere una poderosa quantità di strumentazione impiegata nelle passate attività e custodita in vari locali adibiti a deposito proveniente dal discarico di altri istituti.

Il nucleo originario della Collezione è costituito dalla Collezione di strumenti dell'Istituto di Fisica Sperimentale, istituito con la Facoltà di Medicina e Chirurgia alla fondazione dell'Università di Bari nel 1925. All'epoca si trovava in alcuni locali sotterranei del Regio Istituto Superiore di Scienze Economiche e Commerciali, in Via Trieste. Comprendeva una serie completa di strumenti didattici usati per esperienze dimostrative nei vari settori della Fisica: Elettromagnetismo, Elettrostatica, Meccanica, Ottica, Termologia, etc.