Il Museo custodisce reperti di diverse tipologie e periodi storici provenienti da acquisti sul mercato antiquario o da donazioni di ex-allievi raccolti nel XIX secolo dal Padre Leopoldo De Feis, docente di latino e poi Rettore dell’Istituto “Alle Querce” di Firenze.
Tra i materiali di indubbio interesse la statuetta di Minerva donata a P. De Feis dal Marchese Carlo Strozzi in occasione di un incontro e proveniente da Siena, un gruppo di bronzi dell’Etruria meridionale, il sarcofago in terracotta con immagine femminile distesa sul letto funebre prodotto seriale di officina specializzata. Altro consistente nucleo della collezione proviene dalla donazione della famiglia d’Avalos, feudataria di Montesarchio (l’antica Caudium) in provincia di Benevento. In particolare i reperti esposti provengono dalle necropoli cittadine databili al periodo arcaico. Il terzo nucleo consistente è costituito da iscrizioni di epoca imperiale donate dal padre barnabita Luigi Bruzza e provenienti dal territorio romano.