Il Museo nasce negli anni '20 come raccolta di materiali didattici scientifici provenienti dalla "Sala Casartelli" dell'Istituto Carducci, acquisiti da Enrico Musa a Parigi. Gli oggetti esposti riguardano prevalentemente la biologia (anatomia umana con campioni in scala 1:1, tavole didattiche murali, ecc.), ma includono anche una sezione zoologica, con esemplari di mammiferi, uccelli, pelli di rettili, ricostruzioni scheletriche di pesci e di altri vertebrati, vere e proprie opere d'arte. Sono numerosi anche i modelli iconografici botanici e le riproduzioni di frutti in cera.