Le origini del Museo Donizettiano risalgono al 1897 quando, in occasione del centenario della nascita del compositore, la grande Esposizione a lui dedicata fece nascere l’idea di avere in città una mostra permanente per celebrare Donizetti.
Il Museo è situato in Città Alta nel palazzo della Misericordia Maggiore, sede dell'Istituto Musicale Gaetano Donizetti. Contiene ed espone cimeli donizettiani, tra i quali primeggiano gli arredi della stanza in cui l'artista morì.
I cimeli provengono dalla collezione della baronessa Giovanna Ginevra Rota Basoni Scotti e ad essi se ne sono aggiunti altri provenienti dalla biblioteca Angelo Mai.