Il Museo Diocesano di San Marco Argentano è sito nella storica chiesa di San Giovanni, non più aperta al culto, ed è stato inaugurato il 25 maggio del 2006. L'area museale è articolata su due livelli: al piano terra è esposta l'argenteria sacra del Seicento e del Settecento e al piano superiore sono collocati i paramenti sacri ed i dipinti che abbracciano un arco temporale che va dal XVI al XVIII secolo. Tra le pregevoli opere si menzionano la Croce reliquiario del XIII secolo in argento laminato e sbalzato e il busto di San Nicola, sempre in argento, commissionato dal vescovo Nicola Brescia nel 1765 e con ogni probabilità proveniente dalla bottega di Filippo Del Giudice.