Il museo, strutturato in moduli espositivi, propone didatticamente il percorso evolutivo della vita sulla Terra e la storia dell’uomo attraverso alcune sue scoperte. In questi moduli espositivi sono sintetizzati alcuni punti fondamentali della nostra storia, e ne è facilitata la lettura mediante l’esposizione di reperti paleontologici e archeologici, pannelli illustrativi, cortometraggi e messaggi multimediali.

Le aree espositive dedicate all'evoluzione della vita sulla Terra sono collegate tra loro da un largo corridoio dove scorre una fascia che rappresenta il tempo e che quantifica visivamente il concetto di numero facilitando la comprensione dei grandi spazi temporali; in questa fascia, arricchita con immagini e didascalie, due centimetri rappresentano un milione di anni. Nelle vetrine si trovano le prime forme di vita: dalle alghe azzurre ai primi invertebrati; con un particolare diorama viene messa in evidenza la conquista della terra da parte degli anfibi e per tale scopo sono esposte delle impronte fossili di un anfibio vissuto oltre 200 milioni di anni fa.