Il Museo degli Strumenti per il Calcolo conserva le collezioni del Dipartimento di Fisica e una ricca collezione di calcolatori oltre ai grandi calcolatori cui è dedicata una galleria apposita. Le sezioni principali in cui sono suddivise le collezioni sono: Calcolatori, Grandi Calcolatori e Strumenti Scientifici.

In ciascuna sezione ci sono delle sottovoci che accompagnano l'utente sempre più in dettaglio nell'indagine dei singoli esemplari della collezione prescelta.

Completano le collezioni museali importanti archivi, quali la parte documentale del Fondo Pacinotti, l’Archivio Pacinotti, l’Archivio Fermi-Persico e l’Archivio Riccardo Felici, conservati adesso dalla Biblioteca di Matematica Informatica Fisica  e quindi dal Sistema Bibliotecario di Ateneo.