Le collezioni ed i reperti sono esposti nelle sale seguendo un ordinamento tendenzialmente cronologico che prende le mosse dalle origini di Romano, prosegue con opere rinascimentali, barocche, dell’800 e del’900, fino a giungere a esempi di arte sacra contemporanea attraverso terrecotte, sculture lapidee e lignee, dipinti, oreficerie e arredi che fanno parte del patrimonio locale. Nel cospicuo numero di oggetti di oreficeria si segnalano la “Pace” a niello, della seconda metà del quattrocento, e l’Ostensorio ambrosiano cinquecentesco.
Il Museo ospita inoltre una qualificata e ricca quadreria ed un numero interessante di reliquiari dal 1600 ad oggi.