Il Museo Civico di Storia Naturale di Morbegno è stato istituito nel 1974, grazie all'impegno di un appassionato locale, Giacomo Perego, e alla disponibilità della Amministrazione comunale. Attualmente, il Museo ha sede in un settecentesco palazzo che sorge sulla sponda sinistra del torrente Bitto, nel centro storico di Morbegno.
Noto come il più importante museo scientifico della provincia di Sondrio ed uno dei più attivi della Lombardia, il Museo di Morbegno pone particolare attenzione agli aspetti naturalistici di Valtellina e Valchiavenna, perseguendo le seguenti finalità istituzionali: Raccolta, conservazione e valorizzazione dei beni naturalistici.
Il Museo possiede collezioni di rocce, minerali, fossili, insetti, anfibi, rettili, uccelli (compresi nidi e uova), mammiferi e un erbario. Tutte queste collezioni vengono costantemente incrementate.