Il museo è allestito in un ex-essiccatoio dell'Azienda Agricola Sperimentale, recuperato con un pregevole restauro. Sui tre piani dell'immobile sono trattati gli aspetti storici, naturalistici, gestionali e produttivi dell'area di Valle Vecchia e della Laguna di Caorle, con pannelli, diorami, plastici, postazioni interattive e la ricostruzione di un casone realizzato con le tradizionali tecniche dei pescatori. Il Museo accoglie anche un ampio laboratorio didattico, un book-shop e una sala conferenze. Le terrazze e la torretta panoramica offrono una visuale a 360° sull’ambiente circostante.