Il Museo espone i numerosissimi reperti rinvenuti nel territorio di Milena, che permettono al visitatore di ripercorrere oltre 7000 anni di storia del territorio grazie ad un allestimento didattico-espositivo curato dalla Soprintendenza ai Beni Culturali e Ambientali di Caltanissetta. La collezione, infatti, segue un ordine cronologico dal neolitico fino all’epoca moderna. I reperti neolitici sono emersi dagli scavi archeologici in località Serra del Palco-Mandria: le ceramiche ritrovate sono riconducibili alla classe a decorazione incisa ed impressa con motivi semplici, costituiti da solcature, reticoli, tratteggi, bande rosse alternate a fasci di linee nere. In alcuni insediamenti risalenti all'età del Rame del complesso Monte Grande-Fontanazza sono stati rinvenuti corredi funerari, anse e tazze.