All’interno dell’acquario ci sono 14 vasche di acqua salmastra per un totale di 21000 l di acqua. Prima, le vasche erano collegate con la laguna, mentre oggi sono indipendenti. Oltre ai pesci tipici della laguna, si trovano anche alcune specie dei piccoli laghi della zona. Anche i bambini avranno la possibilità di visitare un acquario un po’ diverso, vedendo specie che possono aver visto solo nei libri.

Una collezione di conchiglie e diorami svela le caratteristiche della fauna autoctona e la sezione etnografica coincide con la Casa del Pescatore, che illustra la cultura materiale della comunità lesinese, i costumi e le tradizioni, l'attività della pesca e le condizioni di vita della popolazione.