Le collezioni paleontologiche del Dipartimento di Scienze della Terra “A. Desio” sono nate dalla raccolta effettuata, nel corso degli anni, durante lo svolgimento di attività di ricerca sia in Italia che all'estero. Il patrimonio paleontologico del Dipartimento consiste in una collezione di circa 10000 reperti descritti e pubblicati, una collezione di micropaleontologia (foraminiferi, nannofossili, ostracodi, alghe calcaree, microfacies fossilifere); una collezione di confronto (circa 2000 esemplari) non pubblicati, ma di interesse scientifico ed una collezione di calchi, che raggruppa calchi di tipi di specie conservati presso altre istituzioni italiane e straniere (circa 800 esemplari). A queste si deve aggiungere la collezione didattica (centinaia di esemplari soggetti a rinnovo continuo a causa dell'uso) di supporto alle lezioni e alle esercitazioni dei corsi di laurea, disponibili nell’aula Stoppani del primo piano, sia in esposizione che nelle cassettiere.

Le collezioni sedimentologiche comprendono oltre 2500 campioni ad uso didattico, sia per le esercitazioni in aula sia per lo studio libero degli Studenti di Scienze Geologiche e Naturali. I campioni sono conservati presso l'aula C della sede di via Botticelli 23. Oltre 250 campioni che presentano i principali caratteri sedimentologici delle rocce sedimentarie, sono esposti in vetrine presso un'aula dedicata allo studio, al primo piano.