La specializzazione iniziale del museo fu per i mezzi pubblici su gomma, in particolare filobus, di cui viene curato il restauro e la conservazione e che ora hanno raggiunto la considerevole cifra di 20 diversi esemplari; questo fa del museo il più grosso centro della memoria per tale tipo di veicolo.

In seguito l'interesse si è rivolto anche al settore ferroviario con la rimessa in funzione di un treno storico dotato di locomotiva a vapore degli anni venti che effettua servizio turistico nella zona della Lunigiana. La parte museale dedicata al trasporto su rotaia è stata inaugurata nel 2003 e comprende le locomotive E.626.294 (1937), a vapore 740.278 (1922) ambedue funzionanti e a vapore 640.004 da riattare. Inoltre alcuni carri ferroviari e vetture tramviarie. Essa è situata nelle immediate adiacenze della stazione ferroviaria di La Spezia Centrale, negli edifici dell'ex Squadra Rialzo.