Ospitato nel Palazzo Gallio di San Martino, il Museo è stato completamente rinnovato nel 2005 con un allestimento che trascina il visitatore a scoprire i “misteri” della matematica moderna. Il percorso museale è articolato fra touch screen, monitor con tastierini, strumenti meccanici ed elettronici e dispositivi interattivi che permettono di interagire e comunicare direttamente con gli apparati scientifici.
Ogni sala sviluppa un tema specifico, con suggerimenti, spiegazioni, collegamenti ai principali siti ove è possibile trovare tutorial sulla matematica a qualsiasi livello e possibilità di eseguire download di testi, curiosità e giochi matematici Il visitatore viene sollecitato ad interagire con gli apparati con l'intenzione di svelargli (non spiegargli in dettaglio) ogni volta un risvolto della matematica che non era ovvio a priori e che può stimolarne la curiosità. Lo scopo del Museo, oltre a quello di avvicinare nella maniera più semplice possibile il maggior numero di persone, studenti e non, alla matematica, è di spronare i giovani studenti ad interessarsi alla disciplina, anche nei loro studi futuri.