Il museo espone i preparati divisi per argomenti e per tecniche di realizzazione: dalla sezione osteologica, all'anatomia dissettoria dei muscoli, dei vasi, dei nervi e dei visceri.

Si segnalano in particolare alcune statue in gesso, collocate in tre vetrine, colorate con pigmenti e sfumature naturali, di autori ignoti e bei modelli in cera ottocenteschi opera di Calenzuoli, artista fiorentino attivo nel Museo di storia naturale di Firenze, e di Ziegler.

Di pregio sono anche i quattro modelli dell'organo della vista realizzati da Tortori, anch'esso preparatore del museo di Firenze. Molti sono anche i preparati in liquido che occupano una decina di vetrine. Tanti gli strumenti anatomici tra i quali seghe, coltelli, microscopi e un trapano da dentista a pedale.