Il Laboratorio delle Macchine Matematiche è un laboratorio di ricerca sulla didattica della matematica (in particolare della geometria) con l’uso di strumenti. In un ampio locale del Dipartimento di Matematica,  è contenuta una parte della vasta collezione di ricostruzioni artigianali funzionanti di antichi strumenti, già al Museo di Storia Naturale e della Strumentazione Scientifica. La collezione completa consiste di oltre 200 pezzi.