L’esposizione museale si sviluppa sui tre livelli dell’ex edificio monastico e dell’annessa chiesa. Le tematiche trattate sono i Parati liturgici, le Immagini sacre, gli Arredi liturgici e Scritti storici, ognuna composta con oggetti provenienti da tutto il territorio diocesano ed esposti al loro interno secondo criteri di provenienza, di ambito e di cronologia. I parati liturgici, prevalentemente dei scoli XVIII e XIX, costituiscono l’inizio del “percorso” che si articola sui tre livelli dell’intero complesso architettonico proprio a partire dalla chiesa.

Al secondo livello sono ubicati i dipinti e le sculture che vengono a costituire la tematica delle Immagini sacre. L’arco cronologico va dal XII al XIX secolo e comprende una diversificata iconografia prevalentemente mariana. Gli Arredi liturgici sono esposti al terzo livello e composti da calici, pissidi, ostensori, reliquiari ed altri arredi in metallo ed inquadrabili ai secoli XVII-XX. Le lapidi e le sculture a bassorilievo in pietra, che compongono la tematica degli Scritti storici, sono posizionate al primo livello.